Nel settore un tempo destinato alle donne e all’infanzia abbandonata, incentrato sulla presenza di due corti, è stata recentemente allestita la collezione Piccolomini Spannocchi, importante collezione di opere raccolte dalle due famiglie e riunite per via matrimoniale nella seconda metà del Settecento.

Al livello sottostante si sviluppano vari percorsi museali, centrati sulla presenza di una piccola corte (corticella). Negli ampi spazi dell’antico granaio sono musealizzati gli originali marmorei della Fonte Gaia di Jacopo della Quercia affiancati ai calchi e ai gessi di Tito Sarrocchi per la replica ottocentesca; sulla corte si affacciano la sede storica della confraternita dedicata dal tardo ‘400 a Santa Caterina della Notte nei cui spazi si conservano arredi e opere d’arte e la scala di accesso alla sottostante confraternita di Santa Maria sotto le Volte.

I livelli I e II, posti nella parte più bassa della struttura e interessati da ampi spazi voltati e lunghe gallerie scavate nell’arenaria, si sviluppano lungo il percorso di una vera e propria strada, inglobata dall’ospedale nel corso della sua espansione a valle, che costituisce oggi un affascinante percorso interno di collegamento fra vari livelli. Gli spazi recuperati ospitano il Museo Archeologico Nazionale che raccoglie le testimonianze e i reperti del territorio senese e di importanti collezioni locali e il percorso “Siena. Racconto della città dalle origini al Medioevo”.